Doctorant F/H Méthodes de fusion multi-modale et multi-échelle basées sur l'apprentissage profond génératif

Le centre Inria d'Université Côte d'Azur regroupe 42 équipes de recherche et 9 services d’appui. Le personnel du centre (500 personnes environ) est composé de scientifiques de différentes nationalités, d’ingénieurs, de techniciens et d’administratifs. Les équipes sont principalement implantées sur les campus universitaires de Sophia Antipolis et Nice ainsi que Montpellier, en lien étroit avec les laboratoires et les établissements de recherche et d'enseignement supérieur (Université Côte d’Azur, CNRS, INRAE, INSERM ...), mais aussi avec les acteurs économiques du territoire.

Présent dans les domaines des neurosciences et biologie computationnelles, la science des données et la modélisation, le génie logiciel et la certification, ainsi que la robotique collaborative, le Centre Inria d’Université Côte d’Azur est un acteur majeur en termes d'excellence scientifique par les résultats obtenus et les collaborations tant au niveau européen qu'international.

Le projet MediTwin est un projet d’envergure visant à développer des jumeaux numériques du corps humain pour aider à la prévention, au diagnostic et au traitement de différentes pathologies. Au sein de ce projet, plusieurs thématiques en modélisation et en analyse d’images médicales sont abordées, dont le sujet de la génération de données synthétiques.

Ce projet de thèse est sur le développement de méthodes d’apprentissage profond génératives afin d’augmenter les données disponibles sur un patient. L’idée est de pouvoir profiter de bases de données disponibles de haute qualité et de haute résolution, ou de multiples modalités pour améliorer et compléter les images disponibles en routine cliniques.

Ceci sera développé plus particulièrement pour l’imagerie cardiaque et dans le cadre de la stratification du risque d’arythmie, qui est une application de MediTwin. En effet, une connaissance détaillée du tissu cardiaque et notamment de l’infarctus responsable de troubles du rythme est un élément important dans une telle prédiction.

Ce projet vise donc à intégrer toutes les modalités disponibles aux différentes échelles afin de construire une représentation la plus détaillée possible du substrat structurel des arythmies cardiaques. Ceci reposera sur des données expérimentales ainsi que de l’imagerie clinique. La méthodologie envisagée est d'étendre les approches d'intelligence artificielle génératives actuelles afin de pouvoir proposer à terme la micro-structure la plus probable étant donné les images acquises sur un patient. Un jumeau numérique personnalisé pourra être exploité afin d'évaluer la plausibilité des données générées.

L’intégration de l’IA générative et de la simulation permettra d’améliorer le réalisme des images produites, ce qui reste compliqué en santé. La collaboration avec l’IHU Liryc (Bordeaux) permet d’avoir accès à des données de nombreuses modalités d’imagerie cardiaque, à de multiples échelles, ainsi qu’à des données cliniques avec le CHU de Bordeaux.

Analyse de données d'imagerie cardiaque

Développement de méthodes d'IA générative

Mise en oeuvre de jumeaux numériques

Développement logiciel (Python)

Apprentissage profond

Analyse d'images

• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
• Accès à la formation professionnelle
• Participation mutuelle (sous conditions)

Durée: 36 mois
Localisation: Sophia Antipolis, France
Rémunération brute mensuelle : 2200€ (2025) et 2300€ à partir de 2026.