Ingénierie logicielle / Code modulaire pour la planification chirurgicale
Type de contrat : CDD
Contrat renouvelable : Oui
Niveau de diplôme exigé : Bac + 5 ou équivalent
Fonction : Ingénieur scientifique contractuel
A propos du centre ou de la direction fonctionnelle
Le centre de recherche Inria de Saclay a été créé en 2008. Sa dynamique s’inscrit dans le développement du plateau de Saclay, en partenariat étroit d’une part avec le pôle de l’Université Paris-Saclay et d’autre part avec le pôle de l’Institut Polytechnique de Paris. Afin de construire une politique de site ambitieuse, le centre Inria de Saclay a signé en 2021 des accords stratégiques avec ces deux partenaires territoriaux privilégiés.
Le centre compte , dont 27 sont communes avec l’Université Paris-Saclay ou l’Institut Polytechnique de Paris. Son action mobilise plus de 600 personnes , scientifiques et personnels d’appui à la recherche et à l’innovation, issues de 54 nationalités
Contexte et atouts du poste
Au sein de l'équipe Simbiotx, nous construisons des jumeaux humains virtuels afin de faire progresser la compréhension des maladies et la planification des traitements. Notre logiciel peut simuler l'ensemble de la circulation sanguine. Notre prochaine étape consiste à en faire un logiciel utilisable par de nombreux types d'utilisateurs, rapide à personnaliser pour chaque patient et flexible pour prendre en charge davantage de cas d'utilisation.
En particulier, nous avons développé des modèles 0D basés sur la physique de l'ensemble du système cardiovasculaire, y compris les poumons, le cœur et d'autres organes et composants tels que les shunts artificiels, en fonction de la question biomédicale en jeu [Audebert]. Ces modèles sont généralement personnalisés pour chaque patient, avec une estimation automatique des paramètres [Pant] à partir des données. Le code doit fonctionner rapidement pour l'analyse de sensibilité [Sala] et la quantification de l'incertitude.
Ces modèles ont été principalement utilisés par les chercheurs et les chirurgiens pour prédire les variables physiologiques après la palliation d'une cardiopathie congénitale, le traitement de l'hypertension pulmonaire et la chirurgie du foie (résection, nouveau type de chirurgie,...). Afin de consolider ces différents modèles et d'améliorer les possibilités de développement, la modularité et la facilité d'utilisation par une diversité d'utilisateurs, nous avons décidé de remanier le logiciel principal. Ce logiciel est une partie importante du projet européen ERC MoDeLLiver pour être en mesure de fournir aux cliniques, en collaboration avec plusieurs hôpitaux.
Mission confiée
Nous recherchons un ingénieur logiciel talentueux pour développer la nouvelle génération de notre logiciel de modélisation cardiovasculaire. Votre mission consistera à définir les éléments fondamentaux et à développer en collaboration une nouvelle version de ce logiciel.
Précédemment codé en C, nous prévoyons de passer à C++. La conception du nouveau code sera développée avec les objectifs suivants :
- Modularité - créer une architecture qui permette une modélisation plus rapide, plus intuitive et plus facile. Les composants individuels du modèle devraient être fournis sous forme de briques élémentaires indépendantes les unes des autres, ce qui facilitera leur interaction.
- Flexibilité - fournir des options pour interagir avec d'autres logiciels et modèles.
- Extensibilité - permettre un développement plus efficace de nouveaux composants (par exemple, de nouveaux organes, composants de base ou fonctions). En particulier, la conception doit permettre une extension naturelle de l'interface graphique.
- Performance - le code doit rester raisonnablement rapide, en particulier pour la chirurgie en temps réel.
Si vous êtes un ingénieur logiciel passionné qui cherche à acquérir de l'expérience en rejoignant un projet passionnant et très prometteur, contactez-nous ! Vous participerez activement à la redéfinition de l'architecture, à la refonte des éléments de base, au développement, à la gestion et à la maintenance de notre logiciel de pointe qui a toujours fourni des résultats précis et qui comporte de nombreuses autres applications prometteuses.
Principales activités
Activités :
- Décider et justifier en collaboration une nouvelle architecture, puis l'implémenter en C++.
- Développer de nouvelles caractéristiques, fonctions et composants basés sur la physique.
- Maintenir et améliorer le pipeline CI/CD, y compris les runners GitLab, le registre des conteneurs et les images Docker.
- Tests de logiciels - tests unitaires ; tests d'intégration ; tests e2e.
- Rédiger de la documentation.
- Contribuer aux publications scientifiques issues du projet.
- Veille technologique, notamment dans le domaine de la dynamique des fluides numérique et des modèles cardiovasculaires 0D : état de l'art, développement et/ou déploiement de preuves de concept (PoC), etc.
- Création de supports de formation pour les développeurs/utilisateurs de l'équipe.
- Conseil et expertise en développement technologique pour les membres de l'équipe et leurs collaborateurs.
Compétences
- Solides connaissances et expérience en matière de développement de logiciels :
- Vaste expérience du développement de logiciels, en particulier en C et en C++ moderne.
- Connaissance approfondie et expérience des modèles de conception
- Maîtrise des outils et des pratiques de développement logiciel, y compris : pipelines CI/CD, documentation, tests logiciels, Docker, Runners, versioning.
- Connaissance de l'administration système Debian GNU/Linux
- Expérience dans la modélisation de systèmes basés sur la physique
- Connaissance et compréhension approfondies de l'analyse des équations algébriques différentielles et des méthodes numériques
- Connaissance de la méthode scientifique associée à l'expérimentation (science reproductible, science et technologie de pointe, contribution à des publications scientifiques sur les méthodologies et la mesure des performances).
- Niveau d'anglais professionnel requis
Avantages
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale
Rémunération
Selon profil
Informations générales
- Thème/Domaine :
Modélisation et commande pour le vivant
Ingénierie logicielle (BAP E) - Ville : Palaiseau
- Centre Inria : Centre Inria de Saclay
- Date de prise de fonction souhaitée : 2024-10-01
- Durée de contrat : 2 ans
- Date limite pour postuler : 2024-09-30
Attention: Les candidatures doivent être déposées en ligne sur le site Inria. Le traitement des candidatures adressées par d'autres canaux n'est pas garanti.
Consignes pour postuler
Sécurité défense :
Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n°2011-1425 relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.
Politique de recrutement :
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.
Contacts
- Équipe Inria : SIMBIOTX
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Recruteur :
Vignon Clementel Irene / Irene.Vignon-Clementel@inria.fr
A propos d'Inria
Inria est l’institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface d’autres disciplines. L’institut fait appel à de nombreux talents dans plus d’une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d’appui à la recherche et à l’innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'efforce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.